近年來，馬陵中學高度重視學科競賽工作，學科競賽參與的層次和人數都有大幅提升。馬陵中學2019年數理化生奧賽再創佳績：2019年第35屆全國高中數學聯賽省二等獎1人；2019年第36屆全國中學生物理競賽全國三等獎2人，江蘇省二等獎2人，江蘇省三等獎4人；2019年江蘇省第33屆化學奧林匹克競賽江蘇省一等獎1人，江蘇省二等獎6人，江蘇省三等獎15人；2019年第28屆全國中學生生物學聯賽全國三等獎1人，江蘇省一等獎3人，江蘇省二等獎19人。