迄今對手足口病尚無特殊疫苗，亦無特效的抗病毒藥物。可服一些抗病毒的藥物以及解毒中草藥進行預防。接觸患者的嬰兒可注射丙種球蛋白，口服脊髓灰質炎減毒活疫苗也有一定的腸道干擾作用。早期發現、早期隔離、早期治療患者，仍是行之有效的控制本病不發生繼發感染的有力措施。家庭和托幼機構的傳播是本病社會傳播的主要機制，因此，在本病流行地區和季節，家長和幼兒園應要求孩子注意個人衛生，飯前便后用肥皂認真洗手以免染上病毒，幼兒園一旦發現第一例病孩應馬上隔離并消毒所有玩具和房間。同時，家長和老師應注意保持室內空氣清新，利用陽光或紫外線消毒，注意環境及飲食衛生，防止接觸傳播。